為了讓電影在尊重事實的基礎上以最大程度接近真相，拍攝團隊及林超賢更親自多次奔赴金三角地區實地考察，請來當地人做嚮導，採訪普通民眾，揣摩他們在這裡的生活狀態和心理活動，更真實記錄了金三角新教父糯康的審訊過程為電影作為參考！

　　導演在現場拍陸地場景時，會騎著摩托車奔波於各個場地；在拍攝海景時，更是騎著水上摩托車穿梭於片場之中工作。【湄公河行動】採用實境拍攝，場景龐大宏偉，影片多使用俯拍、航拍等拍攝方法，場景龐大宏偉，令觀眾能全方位瞭解到湄公河慘案的發生與破案過程。

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　　【湄公河行動】亦特別拿到境外持槍許可，因此演員和工作人員在拍攝現場不得不穿著真正的防彈衣進行拍攝。在導演的率領下，工作人員不惜上山下海，在山溝河道和深山老林展開拍攝，實在博命！

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