「夢」是非常私密的領域，有著所謂「未被滿足的渴望與欲求」，是最不願被外人知的一面。它代表著一個人的潛意識，在當事人尚未察覺時，往往就潛進人最幽深的意識核心中，從此根深蒂固。

在盜夢偵探中，因為夢境機器的失竊而以「紅辣椒Paprika」進入夢境中調查案件的「千葉博士」，正是穿梭在夢境中來去自如的高手。

因為夢境機器失竊，遭惡意人士操弄，導致研究人員們陷入集體夢境中，無法分辨現實與夢境，變得瘋狂又不可理喻。為了拯救人們，也為了找出幕後主謀，「千葉博士」與其搭檔「時田」不得奮不顧身的跳進夢境中，卻也在調查、追逐過程中，漸漸分不清楚夢境與現實，兩者之間的界線逐漸扭曲模糊。