戰鬥是活下去唯一的路……
宇宙世紀0079年，距離地球最遙遠的宇宙殖民地:SIDE-3以吉翁公國之名，向地球聯邦政府發起了戰爭。居住在SIDE-7的少年：阿姆羅．雷，在吉翁軍的偵察任務中，偶然啟動了MS「RX-78-2 鋼彈」，並擊毀兩台MS「MS-06F 薩克」。
之後阿姆羅和難民們搭上了聯邦軍新開發的宇宙戰艦「白色基地」，一邊躲避吉翁軍的追擊，一邊繼續著旅程。 在紅色彗星－夏亞．阿茲納布爾的攻擊下，許多人失去了生命。
但只要還活著，阿姆羅就必須駕駛鋼彈不斷的戰鬥下去……