當黑暗勢力籠罩紐約市，人民就需要英雄。鬥志高昂又義無反顧的四隻忍者龜以人類想像不到的面貌出手相救，打擊犯罪。

來自漫畫作家彼得雷德和凱文伊斯特曼筆下的忍者龜一直以來都深受各年齡層的粉絲喜愛，經過數十年仍歷久不衰，並在21世紀繼續發光發熱。在犯罪和恐懼不斷蔓延的城市裡，許瑞德和他所率領的邪惡腳足家族把警方和政客牢牢控制在魔掌中，未來的前景更是一片黑暗，直到離群索居的四位忍者龜兄弟挺身而出。

他們在一場變調的科學實驗中存活了下來，從下水道崛起並承擔使命，成為戴著面具的終極正義使者。面對許瑞德想要支配整座城市的殘酷計畫，忍者龜將和勇敢無懼的女記者艾波歐尼爾（梅根福克斯 飾）以及愛耍嘴皮的攝影師凡恩芬維克（威爾阿奈特 飾）通力合作，拯救紐約市民。